大多數(shù)苗族人虔信巫術(shù)。主要的巫術(shù)活動(dòng)有過(guò)陰、占卜、神明裁判、祭鬼等，此外還有蠱術(shù)等。巫術(shù)活動(dòng)由巫師主持。巫師大多是非職業(yè)化的。他們?cè)谇笆龈鞣N原生性崇拜和巫術(shù)活動(dòng)中起著主持者的角色，有的地方巫師還兼任寨老。巫師除了熟悉祭祀方法外，大多還能講述本宗支的譜系、本民族重大歷史事件和遷徙來(lái)源的路線(xiàn)，熟悉各種神話(huà)傳說(shuō)、古歌古詞和民間故事，有的巫師還兼有歌師和舞師的職能。所以說(shuō)，巫師是苗族傳統(tǒng)文化的重要的傳承人，在苗族社會(huì)中充任知識(shí)分子的角色。此外，巫師還掌握一定的醫(yī)術(shù)，懂得一些草藥，在為人驅(qū)鬼的同時(shí)，輔以科學(xué)的醫(yī)藥手段。

除了這些傳統(tǒng)信仰之外，自近代以來(lái)，隨著西方傳教士深入我國(guó)內(nèi)地傳教，在滇黔川交界地區(qū)、貴州凱里、湖南沅陵等地區(qū)有一些苗族群眾皈依了基督教，在滇東南有少數(shù)苗族信仰天主教。尤其是滇東北、黔西北一帶的基督教信仰曾經(jīng)勢(shì)頭強(qiáng)盛，影響極大。外國(guó)傳教使團(tuán)或者傳教士們?cè)诿缱宓貐^(qū)開(kāi)設(shè)了許多的中小學(xué)校、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、甚至實(shí)施了一些經(jīng)濟(jì)發(fā)展項(xiàng)目，對(duì)于苗族社會(huì)的進(jìn)步、政治地位的改善起到了不可抹滅的作用。著名的牧師有安順的黨居仁、柏格理、張道慧、王樹(shù)德等，前二者均殉職苗區(qū)。

新中國(guó)建立之后，基督教、天主教的影響一度衰微，近年有一定的復(fù)蘇的趨勢(shì)。但是，現(xiàn)在基督教、天主教實(shí)行“三自”，與1950年以前的基督教信仰在社會(huì)組織、社會(huì)影響甚至信仰內(nèi)容方面都有許多的不同。

國(guó)外的苗族，在越南、老撾有少數(shù)苗族信仰天主教。美國(guó)、法國(guó)等西方國(guó)家的苗族也有信仰基督教、天主教的。老撾、泰國(guó)的苗族也受佛教文化的影響。盡管如此，在他們的社會(huì)中，傳統(tǒng)的祖先崇拜、靈魂觀(guān)念等仍在很大程度上的保留。