維吾爾族信仰伊斯蘭教，所以至今保持著宗教禮拜的習(xí)俗。他們每天要做五次禮拜，分別在黎明、中午、下午、黃昏、夜晚舉行。禮拜一般在自己的家里進(jìn)行。他們不崇拜偶像，所以在做禮拜的方向不掛任何人像。此外，每周星期五午后在清真寺舉行一次集體“主麻拜”。每年分別在肉孜節(jié)和古爾邦節(jié)舉行兩次會禮，并且在齋月的每個夜晚都要做禮拜；在禮拜之前，必須淋浴，稱為“大凈和小凈”。大凈要洗全身，小凈只洗手、腳、臉、模頭、凈下。用水擦洗叫“水凈”。在沒有水的地方，可以土、以沙代凈，即把兩手在地面上拍一拍，摸摸臉、搓搓手，也表示了“凈”的意思。

在清真寺做禮拜是件嚴(yán)肅的事情，在進(jìn)入大殿之前，必須脫鞋，不許擤鼻子、吐痰、放屁。參加禮拜的人必須戴帽子、面朝圣地麥加的方向跪在地毯或氈子上，由身著傳統(tǒng)教服、頭戴伊斯蘭帽的伊瑪目(教長)帶領(lǐng)做站立、贊頌、鞠躬、叩頭、跪坐等動作。然后聽伊瑪目宣講教義。禮拜畢，大家相互問候之后，便一一離去。

伊斯蘭教中主持教務(wù)、講授經(jīng)典的謂之阿訇。凡生老病死、婚喪嫁娶，均請阿訇頌經(jīng)，消災(zāi)去邪，賜祥祝福。