2006年1月，橫濱僑界組團(tuán)專程赴媽祖故里湄洲島，由媽祖祖廟法師為訂造完工的媽祖主神像、分神像及100尊小神像舉行分靈開(kāi)光儀式，隨后一路虔誠(chéng)恭護(hù)回橫濱。

3月8日，媽祖主神像在業(yè)已告竣的中華街媽祖廟正殿安座入住。同年3月17日，中華街媽祖廟隆重舉行落成慶典，中國(guó)駐日使館總領(lǐng)事于淑媛、僑務(wù)領(lǐng)事李輝、日本橫濱市市長(zhǎng)中田宏與日本各地華僑華人社團(tuán)、中華街各界代表近千人出席。中田宏市長(zhǎng)特地致辭祝賀，他說(shuō)，為保持中華街整體特色，橫濱市決定放棄原興建高層公寓計(jì)劃，用來(lái)建設(shè)對(duì)弘揚(yáng)媽祖及中華文化具有特別意義的媽祖廟。媽祖是中華文化中的海神，而橫濱也是海港城市，希望媽祖也能保佑橫濱。

慶典儀式上，該廟理事會(huì)九位理事人人身著藍(lán)色中式長(zhǎng)袍，向媽祖神像行三叩九拜大禮，虔誠(chéng)敬獻(xiàn)主香，祈愿天后娘娘保佑僑民僑社平安吉祥。當(dāng)?shù)刂腥A學(xué)校學(xué)生還表演富有中國(guó)南方特色的獅子舞，廟內(nèi)外人潮如涌，鞭炮鑼鼓聲此起彼伏。

儀式結(jié)束后，人們爭(zhēng)先恐后進(jìn)廟燒香朝拜媽祖。自此，媽祖廟成了橫濱中華街又一地標(biāo)性建筑，更是日本弘揚(yáng)媽祖文化最大信仰中心。