為與滿洲八旗有別，命孔、耿所部使用白鑲皂旗幟，即白旗鑲黑邊，受皇太極直接統(tǒng)轄。這是第一次出現(xiàn)打著有別于滿洲八旗旗幟的漢軍。漢人既然可以編成軍，皇太極決定自己建立漢軍，下令從所屬的滿洲八旗的漢人壯丁中每十名抽出一名，組成一旗漢軍，這是皇太極組成漢軍的開始。隨著軍隊(duì)的發(fā)展，崇德二年(公元1637年)，即皇太極稱帝改后金為大清的第二年，又分漢軍旗為兩旗。又過(guò)五年，崇德七年(公元1572年)，把漢軍擴(kuò)為八旗。至此，漢軍八旗正式出現(xiàn)，成為清朝三軍之一。所使用的旗幟和滿洲、蒙古相一致，即正黃、鑲黃，正白、鑲白，正紅、鑲紅，正藍(lán)、鑲藍(lán)。

由于漢軍編成八旗，所有旗下成員都是旗人，也稱漢軍旗人。因此，應(yīng)說(shuō)旗人是由滿、蒙古、漢三族人組成的，而不能說(shuō)旗人都是滿人。