愛沙尼亞人原先只有名字，沒有姓氏。名字的來源于宗教圣徒或神話人物的名字，以及職業(yè)職務、性格外貌、住地封地等的語詞，如作家烏諾?拉特（英語：Uno LAHT，愛沙尼亞語：Uno LAHT，1924～2008）的名字“烏諾”（Uno）源自拉丁語，意為“第一”，詩人阿圖爾?阿里克薩爾（英語：Artur ALLIKSAAR，愛沙尼亞語：Artur ALLIKSAAR，1966～ ）的名字“阿圖爾”（Artur/Artur）意為“像熊一樣（健壯）”，女子網球運動運員卡婭?卡內皮（英語：Kaia KANEpI，愛沙尼亞語：Kaia KANEpI，1985～ ）的名字“卡婭”（Kaia/Kaia）源自希臘神話中的地母蓋亞（Gaia），等等。

古代的愛沙尼亞人只有名字，沒有姓氏，如愛沙尼亞神話的國王名叫卡列夫（英語：Kalev，愛沙尼亞語：Kalev）。在日耳曼、丹麥、瑞典等國（民族）的相繼入侵和統(tǒng)治下，愛沙尼亞人的名字也受到了影響，其顯著特征是引進了姓氏，即在名字的后面加上姓氏，同時還在教名后面加上自選名（相當于古代單一的名字），如愛沙尼亞民族文學先驅和現(xiàn)代詩創(chuàng)始人克里斯蒂安?雅克?彼得森（英語：Kristjan Jaak pETERSON，愛沙尼亞語：Kristjan Jaak pETERSON，1801～1822）?，F(xiàn)代人多省略自選名，如瓦胡爾?阿法納西耶夫（英語：Vahur Afanasjev，愛沙尼亞語：Vahur Afanasjev，1979～ ），等等。

愛沙尼亞人姓氏中的主要來源是父名祖名、住地封地、職業(yè)職務、性格外貌、抒情表意等，如作家卡爾?羅伯特?雅克布森（英語：Carl Robert JAKOBSON，愛沙尼亞語：Carl Robert JAKOBSON，1841～1882）姓氏“雅克布森”（Jakobson/Jakobson）意為“雅克布（Jakob）的兒子”，心理學家朱利?艾利克（英語：Jüri ALLIK，愛沙尼亞語：Jüri ALLIK ，1949～ ）的姓氏“艾利克”（Allik/Allik）意為“泉水”，詩人愛坡?伊維斯（英語：Aapo ILVES，愛沙尼亞語：Aapo ILVES，1970～ ）姓氏“伊維斯”（Ilves/Ilves）意為“猞猁”，等等。

愛沙尼亞三大姓氏：塔姆（Tamm/Tamm）、馬基（Magi/M?gi）、伊瓦諾夫（Ivanov/Ivanov）。

現(xiàn)代的愛沙尼亞人采用國際通用的稱謂，即 稱男士為“先生”，稱女士為“夫人”、“小姐”、“女士”。

婦女結婚后要改姓夫姓，如第三任總統(tǒng)阿諾爾德?呂特爾（英語：Arnold RUUTEL，愛沙尼亞語：Arnold RüüTEL，1928～ ，2001～2006在任）的夫人英格麗德?呂特爾（英語：Ingrid RUUTEL，愛沙尼亞語：Ingrid RüüTEL，1935～ ）。

子女要繼承父親的姓氏，如政治家倫納特?喬治?梅里（英語：Lennart Georg MERI，愛沙尼亞語：Lennart Georg MERI，1929～2006，1992～ 2001在任總統(tǒng)）的長子馬特?梅里（英語：Mart MERI，愛沙尼亞語：Mart MERI，1959～ ）、次子克里斯蒂安?梅里（英語：Kristjan MERI，愛沙尼亞語：Kristjan MERI，1966～ ）和女兒屠勒?梅里（英語：Tuule MERI，愛沙尼亞語：Tuule MERI，1985～ ）的姓氏都是“梅里”（Meri／Meri）。